株式会社の場合会社への背任行為は株主への背任行為にならないの？

株主が「本人」になることはないから、ならないよ
この場合の本人は企業

背任罪：他人のために事務を処理する者が、自己もしくは第三者の利益を図りまたは本人に損害を与える目的で、任務に背く行為をして、本人に損害を加えること